>SE410400001 Theobroma cacao, chromosome/scaffold:Tc09 start:21815704 end:21816024, TSD:1-3, 319-321, from MITE family DTC_Thc1, SuperFamily CACTA
GAGCACTACAACAAATTTGACCTAAGACAGCACATTTTTAAAATGTGCTACTAAAATTATTTTTAATAACATTTTTTTTTATATTTTTTAGAACAATTTTGTAAATCTAACCTCACTATATAAATTTTTAGATGCATTATGAATAAAATA
TAACGATAGAAATTGCATGCACTGCCAAAGGTTACATTTTTTTTTATTCCTACTAAATGTGAAAAAAATGAAGCTAAAAGTTTAAATAGCTACACTTTTTAAAATTCTACTATACAAAAAAATATGTCGCTTAAAAAAGTGTGATTAAAA
CTCAATTTTTTTGTAGTGGAG
>SE410200002 Theobroma cacao, chromosome/scaffold:Tc04 start:16836217 end:16836677, TSD:1-9, 453-461, from MITE family DTM_Thc1, SuperFamily Mutator
ATCCCAATTGGCTTAAACCCTAAAAAAGCCCATGTACTATGGCCATTTATTCAACTAAGCCTCTCACTTTTTATTGCATTTAAATAAGCACTTAAACTTTGATTTAGGACCAAACAAACCCTTAACCCTAACAGAAATTTAAGCATTGGT
AGACTTAATCTGGCCGGCCTTTTTGCCCACATGGCATATGACCTGATAAGCTGACATGACCACATGACAGCTATGTGGCAAAATGTGCCAGTTTTTTTTTGCCCATGTCAACTCATCAAGTCATATGTCATGTGGACAAAAAAGGCCAAC
TGCCCTTGGGTCTAATGGCAGTTAAATTTCCGTTACAATTAAGGGCTTTTGGCCTTAAATCAAAGCTTACTAGCTTGTTTGAATGTAATAAAAGGTGAGAGGCTTAGTTGAATAAATGGCCATAGTACAAGAGCTCTTTTAAGGTTTATG
CCATCCCAATT
>SE410200003 Theobroma cacao, chromosome/scaffold:Tc05 start:13806494 end:13806744, TSD:1-9, 243-251, from MITE family DTM_Thc2, SuperFamily Mutator
TTAAACATAGGAAAATATTTGATGTATTGACAATATATATATAGTTTCTATATATTATTAAGTTATCAAATTCTGACACTTCATTAATGAAGTATTATTTTGAAAGAAATAAAAGTTGATATTAAAACCTAACGTCGTTTTGAGACCTTA
TCAACATTTTATTTATTTCAAAATAAGTGTTAAAATTTGATTGCCTGACTATGTATAAAAACTATACATTGTCAACGCATCAAATATTAATCTTTAAACAT
>SE410200004 Theobroma cacao, chromosome/scaffold:Tc00 start:76169191 end:76169730, TSD:1-9, 532-540, from MITE family DTM_Thc3, SuperFamily Mutator
AATTTTTTAGGCATAATGCTCAAATATGTCTCTGAACTATTTAAGAATATTCAAATAAGCTCTTATTCTTTTATTGCATTCAATCAAGTAATTATATTTTTATTTTGAATCAAATAAACCCTTATTACTAATGATTAACTAATTGTCATT
ACTAAAAATGCCACTTGTCATTTTATTCCCACATGTTACTAATATAGCATTTATGTGAAGGGTGAAAAATGTCACATAACTTTATTATCATGCTAAATTAGCATGTCATATCATCATCAATTATGATATGTCAGAATACCATCATCATAA
TCAATTATGATATTTTAATATACTACATCAACATCACGTGATATAGAATAATAAATGATATTTTGATTAAGTCAATCATTAGTCATAAGGGCTTATTAGACTCAAAATAAAAAATATAAGGGTTTATTTGGCTCAAAATAAAAGTATAAT
GACTTGATTGTATGCAATAAAAGTATAAGGACACATTTGAATTTTCTTAGATAGTTTAAAGGTTTTTTTGTATATTATGCCAATTTTTTA
>SE410400005 Theobroma cacao, chromosome/scaffold:Tc07 start:12298932 end:12299249, TSD:1-3, 316-318, from MITE family DTC_Thc1, SuperFamily CACTA
TGTCACTACAATAAAATTGAGTTTTAATTACACTTTTTTAAGTAACCTTTTTTTTGTATAGTGAAATCCTAAAAATTGTACCCATTTAAATTTTTAATTTCATTTTTTTCGCATTTAATACTAATATAAAGTAATGCAACGTTTGCTGGT
GTATGTAATTTCTATTGTTACATTTTATTCATAATACATCTAAAAATTTATATAGTGAAGTCAAATCTGCAAAAATGTTCTAAAAAATATAAAAAAAGTGTTATTAAAAATATTTTTAATACAAATTTTAAAAATGTGCTGTTTTAAGTC
AAATTTGTTGTAGTGTGT
>SE410300006 Theobroma cacao, chromosome/scaffold:Tc09 start:18774112 end:18774867, TSD:1-8, 749-756, from MITE family DTA_Thc1, SuperFamily hAT
CTTGAACTTAGACTTGGCAATTTTGAACCCGACACGTTAACACGACACGAGAAGACACAGGTTAAACAGGTTTTGAGTTTAGTGTTAACGTATTTCGTGTCTAATCGTGTCAGACACATTAAGACATGAAATTTCCGTGTCTTAACGTGT
CTGACACGACAAACACGTTTAAAACACATTTAAACACATTTACTTAATCGTGTTATCGTATTTAATCGTGTTATCGTGTTTAAACGTGTATACGTGACACATTTATTAACCTATTAAAAATTAATAGTTAAAAACTATTTTAATCTTATA
TAAATAATTTTAAATAATTATTTTAATAAGTTTTTTTAATTTTATAAAGGGTATAATGTAATTATACATGCTTAATCTTAATTTTTAACTTTTAGTGATTATTTGATACTATTATTATTTTTGTTTTATTATAATTATTTTTATAATTAT
AGATTTTAAATTTAAATAATAAAATTATATTTAATTGTAAATATTTTTATTTAATTGTATTAAACGTGTTAATCGTGTTAAACATGTTATTAATGGTGTCGTGTCGTACATTAACACGTTTAATAAACATGTTAATCGTATCGTGTCTTA
TTACACGTGTATTAAACGTGTACGTGTACGTGTTTCAAATTTAAAACACGAATATTATACGTGTCATGTTCGTGTTTAGCCTTAACGTATTTCATATCTAATCGTGTCTGACACGTTTACGACACGTTAACACGAATTGTCAGGTCTACT
TGAACT
>SE410500007 Theobroma cacao, chromosome/scaffold:Tc00 start:2218872 end:2219276, TSD:1-3, 403-405, from MITE family DTH_Thc1, SuperFamily PIF/Harbinger
TAAGTGCATGTTTGGTTTAGCTTTTTTTCAACTTATCTACCTCTTAAAAGCAAAAGCCAGGTCAAACATGATTTTTTGAGAAGCTCTTAAAAAAAAAGCAGCTTTTTTTTTAAGAACAAAATTTTTAAAAAAAGAGCTCCAAGGAGGAGC
TTTTTCTTCTCTTCTTTTAAAAATATAAGAGAATTTTTATTTTTGTTCCAAAAATATCCTCATTTATTAAAAATAATTACAATATTACTCTCTCAAAAAAAAAGAAATACCTTCTATGATAATTTTAACAAAAATTATAACTTATAAAAA
GAAATTTACCAAACAACTTTAGCTTAATTTTAAAAGTTATTATTTTTCTTAAGAGCTTCATAATAACTTTTAAGTTAGAAAAAAGTCAAGCCAAACAGGCTCTAA
>SE410500008 Theobroma cacao, chromosome/scaffold:Tc09 start:12593674 end:12594337, TSD:1-3, 662-664, from MITE family DTH_Thc2, SuperFamily PIF/Harbinger
CATGTGTCAAGGTCCACATCAACCCTTGTGAGGTATTATCTGCTTTGGCCCGTTGGCCTCACGATTTTGTCTCACAAAAGGTGCCTCATAGGTTGAAGGGGGTGTGAACTCTTATATGCCCAGTATCACTCTAATACATAGCCAACGTGG
GATTCATGGCTCCCCTCTCTAAGACCATGACATCCTCTTTTACTCCCCGTTGAAAGTTTTTCTTCGATATGGGACTTTTTGGCTTTACCTGCTAGCAACATTATCTCAATGATGTGGGATTCACATCCATGCAAGGATCGTGACATCCTT
CCCCACTTCAACAAGGGTCCACTATCCTCAGTGGCACATCGCTAGTGCTCAGAGTCTGCTTTGATACCAACTATCAAAATCCACACCAACCCCTATGAGGTATTATTCGCTTTATCCACTAGCCTCAGAGTTTTGTCCCACAAAAGGCGC
CTCATAGGTTAAAAGTGTGTGAACTCTTATATGTCCAGTATCACTCTAGTACGTAGCCAATGTGGGATTCATGGCTCCCCTCTCTAGGATCATGACATCTTCCCTTATTCTTCGCTGCAAGTTTCTCTTCAATGTGGGACTTTGTGGCTC
TACCCCCTGGGACCATTATCTCGACAATGTGGGATTTATGGCCACATGAGGACCGTGACACCAT
>SE410200009 Theobroma cacao, chromosome/scaffold:Tc00 start:34629465 end:34629992, TSD:1-9, 520-528, from MITE family DTM_Thc4, SuperFamily Mutator
TTATATTTTGGGTAAAATACCCCTACCCTTTTAAGTTTTAATCGAAATTTCATATAAGTTTATTAGTTTTTAAAATGGACATTTCGTCCCGAGAGTACAAACATCATTAATAGAGATTATAAAAAAAAGTAAAATGCCCTTTCTTTCTTG
ATTAATTTAAAAAATTATTATTATATTTTTTAAAAAAATACAAAATTAAAAAGCACAAATCGATGCTCCCTAGCTCCACAAGAAAGTAGAGCACTAAACAATGCTCCCCAAGGGAGCTTCAATGCTCTCTAGGTGAGAGCTTTTTTTTAA
TTAATAAAAAATTAATAAAATTATATAATAGTTTTAAAAATTAATCAAGGGTAAAATTATCTTTTTGCCCTTGCCACATCATCAAATTGACGGAAACACTAACGACTGGATCTACGTGTCCAGTGAAAAATATTTTTTTGGGGAGGAGAG
TCCATTTTGAAAACTAATGAACTTTTATATAATTTCGATCAAAACTTTGGGGGTGAGGGTATTATACCCTTATATTTT
>SE410200010 Theobroma cacao, chromosome/scaffold:Tc09 start:19492516 end:19493014, TSD:1-9, 491-499, from MITE family DTM_Thc5, SuperFamily Mutator
TTGAATGTTGGCTAAATACCCAAATAAGCTCCTAAACTATGTCAAAAAAATCAATTCAGCTCCTATTCTTTTATTACGTTCAAATAAGCCCCTGAACTTTTCTTTCGAGTCAAATAAGCCCCTTTCCCTAATAGTTGACTAACTTCTATT
AGTCAACTGTACATGTGGCACTTTTATACCATGTCATCTACCACGTGGCAGATGATGTGGCATTTAATATTGTTGATTAGGATCAAGTAAATGGGTAAAAAAGTAAGCACACAAATCCTAATCAATAATATTTAATGCCACATCATTTGC
CACGTGGCAGATAACATGGTATAAAAGTACCACATGTATCGTTGACTAATGGAAGTTAGTCAATGGTTAGGGAGAGGGGCTTATTTGACTCAAAATAGAAGTTCAGGGGCTTATTTGAAAGTAATAAAAGGATAGGAGCTGAATTGATTT
TTTTTTAACTTAGTTCAGGGGCTTATTTGTGTATTTAGCCTTGAATGTT
>SE410200011 Theobroma cacao, chromosome/scaffold:Tc00 start:23395470 end:23396151, TSD:1-9, 674-682, from MITE family DTM_Thc6, SuperFamily Mutator
GACAAATTAGATCAAATTATACAATTAATCTTTATACTCTATCAAAATAGTGAATTTAGTCATTATACAAGAATTTGTAAAAATTGAGTCCTTATACCTTTTAAAATTGATAATGTCAATCCAATGTGCTAAAAATTTTCAATTATCTAT
ATTGATATGACGTTTCGTTGTGTTCATGTGACATTAAATTTGATAACATGACAATGATAATGTGACATTTCACAAATGATATAATAGTAGTATCAATATAACGTGAACAAGTACTAACATGAATTTTATAACTCAAACATAGAATTATCT
AGTGTGAGTTAATGATTTTAAACAGGATTAAAAAAAACAAATTAAAATTATGAATAGATTTTTAGGATCTAGGAAAAAAGTATTGTGAAACAGTGAAGAATTGAATTTTTGTGCTCTATAATTTAAAGCGATGAAAGGAATGTTGTGAAA
TAAATGAAAAATGTCACGTCATCATTAACATATCATCGTATTTAATGTTATATCAGTAAAAAATGCCATCTAAACATAAATAATAAAAACATTTTAATACTGTTAACAATTTGACTAACATGTCAATTTTAAAAAATATAAAGATTCAAT
TTTTACAAATTATTATACAGAAACTAAATCCACTATTTTACCAAAGTACATAGAGTAATTGCATAATTTAACCGATAAATTA
>SE410300012 Theobroma cacao, chromosome/scaffold:Tc03 start:5127140 end:5127663, TSD:1-8, 517-524, from MITE family DTA_Thc2, SuperFamily hAT
CTTTGATGTAGGGGCGGCTCAATACCTTTAAAGGTTTAAAACGATTAAATATTTAAATGAGGTCCTTATTGAGCCAAAAAAAAAAATAAATGAGACCCTTTTTATTGAAATTAAAAAAAATTACTGTTAGTAGGAGATCATTAAAAACAT
ATTCTGTTAATTGAAAATAGAAAAAAAATAATTGAGAATTATTAGCATTATGGGAATTGGGAAGTGATAAAAAATAAAAATTTATTAGACAGATAATTGAGAAAGTGAGAGAATATGTGATTTTATTAATTATTTTGACTTTCACATAAA
TAAGGAAGTGAGATAAATAGTTGAGAATTAATAAGAGATAGGAAGTAAAAGAAAATAAATATTTAATAGACATTTAATTTAAAAAATATTTTATTAATTATTTTAATTTATATATATATTTAATATAATTAATTATATTATATAAATTTA
TGAGGTCTAGAAAATTATGAAGCCTAAAGCAAGGGCTTTGCTGGCTTTATGCTAAAGCCAGCCCTGCTTTGATG
>SE410200013 Theobroma cacao, chromosome/scaffold:Tc03 start:13868529 end:13869067, TSD:1-9, 531-539, from MITE family DTM_Thc3, SuperFamily Mutator
ATTTCATTAGGCATAATGATCAAATAAGCCCCTAAACTATTTAAAAATATTCAAATAAATCTTTATTCTTTTATTACATTCAATCAAGCCGCCGTATTTTTATTTTTAAGTTAATAAGCCCTTATAACTAATGATCTACTAATATTCAAT
AGTAAAAATACCATTTATCATTTTGTATCCATATGGCACTGACATGAAATTAATATGAAAGATAAAAAATATCACATGATTAAGTTATTATACCAAATTAGCAAGATATGCTATCATTAATAATGATATGTCAACATGCCACATTATAAT
CAATTATAATATATTAGCATTTCACATTAGCATCACGAGATATAGAATAATAAATGACATTTTGATTAAATCAATCATTAGTAATAAGAGTTTATTTGACTCAAAATAAAATGTATAGAGATTTATTTGATTTAAAATAAAAGTATAAGG
ACTTAATTGAACGCAATAAAAGTATAAGGGCTTATTTGAATTTTCTTAAATACTTTAGGAGCTTTTTTGTATATTATGCCATTTCATTA
>SE410400014 Theobroma cacao, chromosome/scaffold:Tc09 start:19460673 end:19460991, TSD:1-3, 317-319, from MITE family DTC_Thc1, SuperFamily CACTA
TTACACTATAACAAATTTGACTTAAAGACAGCACATTTTTAAAATGTGCTATTAAAAATATTTTTAATAATATTTTTTTATGTATTTTAGAACATTTTTGTAGATCTAACTTCATTATATAAATTTTTAGATGCAGTATGAATAAAATGT
AATCATAAAAATTACATACACTAGTAAAGATTACATTTTTTTATATTGCTATTAAATGTGAAAAAAGTAAAATTAAAGGTTTAAATAGTTGTACTTTTTAAAATTTTACTATAGAAAAAAATATATCGTCTAAAGAAATGTGATTAAAAC
TCAATTTTTTATAGTGTTA
>SE410500016 Theobroma cacao, chromosome/scaffold:Tc10 start:11655087 end:11655515, TSD:1-3, 427-429, from MITE family DTH_Thc1, SuperFamily PIF/Harbinger
TAAGTGCTTGTTTGGCCTAGCTTTTTTTCAGCTTATTTATCTCTTAAAAGCAAAAGCCAGGCCAAACATAAATTTTGAGAAGCTCGTAAAAAAAAATAGCTTTTTTTTTAAAGAATAAAATTTAAAAAAAAAGAGATTTAGGAAAAGCTC
TTATGAGGAGCTTTTTCTTCTCTTTTTTTAAAAATACAAGAGAATTTTTATTTTTGTTCCAAAAATATCCTCATTTGTTAAAAATAATTACAATATTACCCTCTCAACAAAAAGAAATACTTTCTATGATAATTTTAACAAAAATTATAA
CTTATAAAAAAGAACTTATAAAAAGAAATTTACCAAACAACTTTAGCTTAATTTTAAAAGCTATTATTTTTTATAAGAGCTTCATAATAGCTTCTAAGCTAGAAAAAAGCCGGGCCAAACAGGCTCTAA
>SE410200017 Theobroma cacao, chromosome/scaffold:Tc06 start:1112554 end:1113092, TSD:1-9, 531-539, from MITE family DTM_Thc3, SuperFamily Mutator
TATAATCTTGGCATAATGCTCAAATAAGCTCCTAAACTATTCAAGAATATTCAAATAAACCTTTAGTCCTTTATTACAATCAGTCAAGCCCTTATATTTTTATTTTGAGTCAAATAAGCCTTTATTACTAATGATTGACTAATTGTTATT
AGTAAAAATGCCACTTGTCATTTTATGTCTATATGACACTGACATGGCATTGATGTAGAGGATGAAAAGTATCATATGGTCATATGTTCATGCAAAATTAGCATGTCATGTTATCATCAATTATGGTATACCAATATGCCACATCATCAA
CAATTATCATATTTTAGTATGCCACGTCAGCGTTATGTGGTATAGAATAACAAATGATAATTTGATTAAGTCAAATCATTAGTCATAAACGCTTATTTGATTCAAAATAAAAGTTTAAGGGTTTATTTGGCTTAAAATAAAAGTACAAAG
ACTTGATTGAATGTAATAAAAGTATAAAGACTTATTTGAATTTTTTTAAATAATTTAGGAATTTTTTTGTATATTATGCCTATAATCTT
>SE410300018 Theobroma cacao, chromosome/scaffold:Tc04 start:9640832 end:9641393, TSD:1-8, 555-562, from MITE family DTA_Thc4, SuperFamily hAT
ATCATAATTAGGGGTGAGCAAATGTAAATCGAATCGAACAATCGAACTGAACCGAAATGAGTTCGATTTTTTCAGTTTGGTTAGCTTGATTTTTTGGATAGTTCGGTTAGGATAGTTCAAATTCGGTTGGTTTCAGTTAGAAAAATTTCT
ACCCGAACTAACCAAACTAACCAAACTTAAGTAAGGGTATTATGGGACTTTTGCATAAAAAATAAATCTTAAACCTAATATCTTTTCCTCTTTAGTTTCTCTTTAATTATATGAGTATCCATCTTATTTATTATAATTTTTTACTATCAT
TTTTAATATTTTTATAGTATTGATTTATTAAAAAAATATAGCATAAATAAATATATACAAACAAAAAAATAAAAAATTTGTCAAGTTCGATTTTTGGAAACTGAACCAAACTAACCAAATTTGTTCGGTTTCGATTAATTCGGTTATTTG
TATAGTTCGGTTTAGTTTCAGTTATTATTAAATATGAGTTCAGTTAGTTCGGTTAGTAGACATCTAAAACTGAACTAATTGAAATAACCGTTTGCACACCCCTAATCCGAAT
